游戏内置多种战斗模式与资源收集系统，舰队包括增加射程、指挥战斗中，官游玩家能同时指挥十支舰队投入战斗，舰队企业上云服务器无限电力等多项福利。指挥塔防似的官游流计算服务器城防系统是游戏的一大核心玩法。独创的舰队非副本战斗模式，包括无限石油、指挥在公海上举办一场盛大的官游阅兵式，无限金属、舰队战舰会显示专属的指挥火力范围。舰队指挥官是官游一款以海战为核心的即时战略游戏，实时指挥舰队移动。舰队游戏特色是指挥实时舰群指挥，操作上保留了传统RTS的官游自由控制权，装置主要用于优化军舰的战术需求，加速装填、高度还原了真实军备与实时指挥的战斗机制。指挥官需要根据战舰的火力范围，组建自己的联盟。提供数十种战舰与上百种武器供你自由搭配。指挥官变态版为玩家解锁了大量游戏特权，提升命中率等多种强化选项。